排出积水：需挖排水沟并加强通风，晾干土壤水分，后期严格控制浇水量。
菌肥防治：辣椒烂根常因根腐病，初期可用微生物菌剂灌根，增强抗病力，减少土传病害。
松土透气：辣椒在盐碱土或板结土中易烂根，应及时松土，为辣椒浇稀薄有机肥。
注意事项：种植辣椒时，应选抗病品种，施足腐熟有机肥，进行3-5年轮作，并采用高畦栽培。
一、辣椒烂根如何解决
1、排出积水
辣椒在田间积水过多的情况下会出现烂根现象，此时需要立刻在田间挖出排水沟，并加强通风，晾干土壤中的水分，而且后期浇水时要严格控制水量。
2、菌肥防治
辣椒发生烂根现象，一般是由于感染了根腐病，发病初期可以用微生物菌剂根对植株进行灌根，起到固氮、解磷、壮根的作用，同时增强辣椒的抗病力，减少土传病害的发生。
3、松土透气
辣椒在板结或者盐碱化严重的土壤环境中，也会出现根部腐烂的现象，此时需要及时为其松土，然后为辣椒浇灌稀薄的有机肥，使土壤达到松软透气、肥力充足的状态。
4、注意事项
种植辣椒时，为了减轻病害和虫害的威胁，要因地制宜选择抗病性强的品种，并在种植前施入充分腐熟的有机肥，然后与豆科、禾本科作物进行3-5年轮作，以高畦栽培的方法为宜。
二、辣椒烂杆的原因
1、细菌性软腐病
多从伤口、叶痕侵入，引起枝条表皮腐烂，色灰白，呈浓状，易被弄破露出木质部，而木质部颜色不变，依然为白色。病斑多，发展扩大，或绕茎干一周，发出轻微的腥臭味。也能使果实染病，呈软腐状。
2、疫病
起病急，发展快，属卵菌。多发于主干和主茎的“节”部位，即叶痕处。病斑深褐色或黑褐色，皮层不软腐，木质部变深褐色，病斑开始不凹陷，能生稀疏白霉毛，但环境干燥时较少见。一株或一根枝条上会有多处发生，也能侵入叶片和果实，使之呈水浸状，色不会变褐色，而是呈深绿色腐烂。
3、菌核病
属真菌病，多发生于枝条分杈处，开始为灰白色软腐，病斑不凹陷，后生出白色浓密的白霉，继而聚集产生鼠粪状菌核，病斑下木质部朽烂、干枯，但不变色，髓部会生菌核，上部枝叶会枯死。菌核病也能侵染果实和叶片，使之腐烂，生浓密白霉。
4、灰霉病
也属真菌，多由残花生霉后落在茎干上而引发，也有些是因为老灰霉病斑处滴水而传染到茎部。另外，有的品种属高感，在棚室辣椒经历一冬天的灰霉为害后，棚内灰霉孢子极多，会从植株茎上叶痕、果柄等处侵入引起茎杆腐烂。病斑浅褐色，不凹陷，着生灰色浓密霉毛，绕茎一周后，上部干枯。
5、条斑病
毒病表现是在茎上出现纵向的浅黄褐色条状斑，凹陷，不生霉毛，不腐烂。以生长点下发生较早，也可在粗大的茎干部出现，病株叶柄和果实上也会出现浅褐色条纹斑，果实外观质量差，不可出售，损失严重。
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