我国棉花育种一共经历了四个阶段。
1、第一阶段：该阶段为20世纪70年代前，以系统选育为主。
2、第二阶段：该阶段为20世纪70-80年代，系统选育和杂交选育并存。
3、第三阶段：该阶段为20世纪80-90年代，以杂交选育为主。
4、第四阶段：该阶段从20世纪90年代开始，以转基因抗棉铃虫新品种选育为主，同时进行杂种优势利用和杂交育种。
一、我国棉花育种有多少个阶段
1、以徐州农业科学研究所的育种史为例，徐州农业科学研究所从民国时期直到如今，约走过了四个阶段，第一阶段发生在20世纪70年代之前，当时主要以系统选育为主；70-80年代是第二阶段，是系统选育和杂交选育并存阶段；以杂交育种为主的阶段是第三阶段，发生在80-90年代；从90年代开始就是第四阶段，以转基因抗棉铃虫新品种选育为特征，同步进行杂种优势利用和杂交育种。
2、这四个阶段的育种方式相辅相成，把系统选育和杂交育种相结合，并用杂交育种手段去创造材料变异，然后用系统选育的方法去选择、鉴定育种材料，达到事半功倍的效果。
3、从民国至70年代，因为时代的局限，所以以育种为主，这个阶段强调要选择的基础材料，起点要高，在多中选优和优中选优的选育方针指导下，可以较快选出新品种，但是因为系统育种遗传基础较窄，供选择变异资源仅靠天然形成，所以缺乏一定的可控性，特别是品质和抗逆性状变异不可满足要求。
4、从80年代开始，杂交育种就提升到了一定高度，用了各种方式，不断丰富遗传基础，积累变异资源，让基因重组、累加，不断打破基因连锁而造成的主要经济性状负相关。接着再用混合加系统选育方法选出以及保存这些优良变异变异，从而取得了良好的效果。
二、棉花品种如何选择
1、选择早熟品种，早熟是实现棉花高产稳产的前提条件。
2、选择抗逆性好的品种，比如抗高温、耐低温、抗病虫害的能力等。
3、选择稳产性比较好、适应性强、可塑性比较好的品种，选择吐絮畅、集中不掉絮、容易用机器收获的品种。
4、选择能满足种植地区的栽培条件、适合当地气候环境和土壤环境、株型比较紧凑的品种。
5、选择种子质量好、成熟度和饱满度以及发芽率都可以满足种植要求的品种，还要选择衣分高、绒长的品种。
6、购买种子时要选择正规厂家生产的，选品种的时候不要过于追求高产，而应该强调稳产。
7、注意种子的质量，新的种子质量标准是：原种纯度最低要求99%，净度最低要求99%，发芽率最低要求80%，水分含量不高于12%。
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