科属：红虫属于双翅目、摇蚊科动物摇蚊的幼虫，而蚯蚓为单向蚓目、单向蚯亚目环节动物的统称。
形态：红虫呈圆柱形蠕虫状，全身由头壳和12个体节组成，各体节粗细相近，体色淡、呈血红色。而蚯蚓呈圆柱形，由100多个体节组成，体表覆有薄角质层，除前两节外其余各节均具有刚毛。
食性：红虫主要以水体中的有机物为食，而蚯蚓以树叶、稻草、畜禽粪便、生活垃圾等为食。
一、科属区别
1、红虫：红虫为动物界、节肢动物门、有颚亚门、昆虫纲、双翅目、摇蚊科、摇蚊的幼虫。
2、蚯蚓：蚯蚓为动物界、环节动物门、环带纲、寡毛亚纲、单向蚓目、单向蚯亚目、环节动物的通称。
二、形态区别
1、红虫：红虫圆柱形蠕虫状，身体细长，全长2-30毫米。由头壳和12个体节组成，前3个体节为胸节，后9个体节为腹节。各体节粗细相近，外形无甚差别。体色淡，部分种类因体液中含有血红素而身体呈血红色。
2、蚯蚓：蚯蚓身体呈圆柱形，两侧对称，具有分节现象，由100多个体节组成，在第十一节以后，每节的背部中央有背孔，没有骨骼，属于无脊椎动物，在体表覆盖一层具有色素的薄角质层，除了身体前两节之外，其余各节均具有刚毛。
三、食性区别
1、红虫：红虫多数取食水体中的有机物，在淤泥或有机质丰富的水体中，因为缺少鱼虾等天敌，可以大量繁殖。除了环足摇蚊属中某些专吃植物的种类外，其余种类可分肉食性与杂食性两大类，肉食性种类以甲壳类、寡毛类和其他摇蚊幼虫为食，而杂食性则以细菌、藻类、水生植物和小动物为食。
2、蚯蚓：蚯蚓体内可分泌出一种能分解蛋白质、脂肪和木质纤维的特殊酶，树叶、稻草、畜禽粪便、生活垃圾、活性污泥和造纸、食品工业的下脚料等，都可以是它的食料，可以在一定程度内消除环境污染。
四、作用区别
1、红虫：红虫在加速水体物质循环中的有机物矿化作用和消除有机物污染方面具有显著作用，在生态学和环境科学领域中得到广泛的应用，又是鱼类的优良天然饵料，营养价值非常高，因此与养渔业的关系密切。
2、蚯蚓：蚯蚓中药称地龙，性寒味咸，性寒，功能为清热、镇痉、止喘、利尿，主治高热狂躁、惊风抽搐、头痛目赤、喘息痰热、中风、半身不遂等病证，中医治疗前列腺等湿热下注泌尿感染等病中的常用中药，提供取液有良好的定咳平喘的作用，灰与玫瑰油混合能治秃发。
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